Разработка метода полимеразной цепной реакции для диагностики фитопатогенного гриба Zymoseptoria tritici
DOI:
https://doi.org/10.31489/2019bmg3/33-40Keywords:
Zymoseptoria tritici, фитопатогенный гриб, диагностика, специфичность, чувствительностьAbstract
Своевременная диагностика — залог успешного проведения профилактических мероприятий по устранению тех или иных болезней. Для быстрой детекции и точной идентификации возбудителя вызывающего пятнистость листьев пшеницы необходима разработка высокочувствительного и скоростного метода анализа. В данных исследованиях проведены работы по разработке высокоспецифичного метода ПЦР для диагностики фитопатогенного гриба Zymoseptoria tritici. В результате исследований были отобраны нуклеотидные последовательности для Zymoseptoria tritici из базы данных GenBank. Используя данные последовательности, были сконструированы и синтезированыспецифические праймеры. Проведены работы по отработке оптимальных условий проведения ПЦР по таким параметрам, как концентрации ДНК полимеразы, ионов Mg2+ и дНТФ. Также осуществлены работы по определению чувствительности и специфичности разработанного метода ПЦР. Чувствительность данного метода составила 0,69 пг ДНК патогена в исследуемом материале. В результате исследований специфичности установ-лено, что разработанный метод не выявил ДНК гетерологичных грибов. Таким образом, разработанный метод диагностики на основе ПЦР для выявления гриба Zymoseptoria triticiпоказал высокую специфичность и чувствительность который в дальнейшем может использоваться в качестве диагностического набора на основе ПЦР для выявления гриба Zymoseptoria tritici.